当两个被历史标记为失踪和死亡的科学狂人重新聚集在一起的时候，注定会引导出不寻常的事件。疯狂博士和达芬奇各自在自己的研究领域里，发现了一份古老的文献，追寻着文献中的蛛丝马迹，拼凑来自传说故事中的细枝末节——混沌的初始之神苏醒之后，在没有完成统一的野心后，突然又一次从奥斯大陆上消失了。这位初始之神将自己的一部分力量分割到体外，凝聚为一枚混沌核心。毫无疑问，这枚核心所蕴含着令二人垂涎不已的力量。
科学狂人二人组扭曲的执着得到了回报。他们一同来到了混沌核心所沉睡的遗迹之外，同属黑暗科学的他们很快达成了合作协议。沉睡在遗迹深处的混沌深巢重见天日，神的寝宫被疯狂科学家们的酸液爆弹炸开。他们设法盗走了凝聚混沌之力的核心，在他们的实验室中，基因技术与机械技术为混沌核心赋予了一具新的“肉体”。两位科学家对新造物的命名争执不下，经过一局紧张刺激的象棋对决，他终于被确定命名为“欧米伽”。
然而没等两位科学家开香槟庆祝这次巨大的成功，欧米伽就一炮打穿实验室的外墙，从疯狂博士和达芬奇的眼皮子底下逃走了。他肩负的多重火炮所向披靡，无论是疯狂博士的突变生物仆从，还是达芬奇的发条守卫都不是他的对手。混沌之力所驱动的机械生命体突破了一道又一道防线，很快，欧米伽就逃出了秘密实验设施，将狂怒的斯坦因和达芬奇远远甩在身后。年轻的实验体开始了他在这片陌生的大陆上的旅行，虽然有些茫然无措，但他的“内心”却始终在引导着他往大陆的边缘，被称为终末之地的地方迈去。欧米伽并不知道整个世界的命运都会因为这趟旅途而改变，光与暗的制衡，过去与未来的纠缠，两位疯狂的科学家穷追不舍，而“内心”的主人正在远方的王座上等待着他的归来……欧米伽的冒险，才刚刚启程。